За інформацією чеського видання Respekt та естонського Delfi європейські спецслужби вважають, що ГЛОНАСС може використовуватися для шпигунства. Система має можливість відстежувати місце розташування ядерної зброї країн Заходу і стежити за військовими кораблями НАТО.

Литва також відмовила Росії в цьому. Спецслужби попередили, що РФ може використовувати систему, щоб отримати контроль над вантажами, які перевозяться між Росією, Казахстаном, Білоруссю, Китаєм і ЄС.